Ned fue criado en Nueva York por dos Nihilistas de la generación Beat (parecidos a John Lennon y Yoko Ono ). Su rechazo a la disciplina y su terrible crianza hicieron de la infancia de Ned un terror. Terminó siendo puesto en un proceso experimental de ocho meses de nalgeadas (en la Universidad de Minnesota) donde se suprimió toda su sensación de odio. Éste resultado en Ned es que toda su vida odiara a sus padres – una de sólo dos cosas que odia, además de la oficina de correo. También, toda la familia juega juegos de mesa pero no tiran los dados, ya que Ned cree que son "malditos". Rod dice que mueven un espacio por turno, porque es "¡menos divertido el camino!". Sin embargo, en el episodio La primera palabra de Maggie, uno ve claramente a Rod, Todd y Bart jugando un juego de mesa con dados.
Ned Flanders se graduó en la Oral Roberts University donde él perteneció a una fraternidad.
En una ocasión Ned Flanders se convirtió en el director de la Escuela Primaria de Springfield después de que Seymour Skinner fuese expulsado, a pesar de que Ned carece de habilidad administrativa y experiencia como director. Ya que la escuela estaba poco firme en su comienzo, la escuela está tan mal o peor que antes de comenzara a ser Director, poniendo el lugar entero en un sistema de honor en vez de un tradicional castigo. Bart decide finalmente que Skinner debe ser reinstalado, ya que no es el Némesis que Bart está buscando, debido a que Ned no tiene el carácter de Skinner. Así, Ned termina siendo expulsado después de que el Inspector archundia escuche una oración Cristiana en el altavoz, ya que no está permitido en una escuela pública.